Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms