Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prr27Q3SYJ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prr27Q3SYJ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms