Protein–RNA interactions for Protein: Q3B807

Tcerg1l, Transcription elongation regulator 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1lQ3B807 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tcerg1lQ3B807 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcerg1lQ3B807 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcerg1lQ3B807 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms