Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 ATG17YLR423C 1254 nt7.43□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 RNH201YNL072W 924 nt7.43□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 TAE1YBR261C 699 nt7.43□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 SRF1YDL133W 1314 nt7.43□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 GPD2YOL059W 1323 nt7.43□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 ERS1YCR075C 783 nt7.42□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 HMS2YJR147W 1077 nt7.42□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 YNL165WYNL165W 1221 nt7.42□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 CUP2YGL166W 678 nt7.41□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 YHM2YMR241W 945 nt7.41□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 KSH1YNL024C-A 219 nt7.41□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 NUP84YDL116W 2181 nt7.41□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 CCT8YJL008C 1707 nt7.41□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 YOR389WYOR389W 1875 nt7.41□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.4□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 LYS1YIR034C 1122 nt7.4□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 YLR463CYLR463C 552 nt7.4□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 YNL017CYNL017C 339 nt7.4□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 IRC11YOR013W 471 nt7.4□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 FSF1YOR271C 984 nt7.4□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 CTF19YPL018W 1110 nt7.4□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 NMT1YLR195C 1368 nt7.4□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 YBR241CYBR241C 1467 nt7.39□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 HBN1YCL026C-B 582 nt7.39□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 FAL1YDR021W 1200 nt7.38□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 BUR6YER159C 429 nt7.38□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 YJR146WYJR146W 354 nt7.38□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 OPI11YPR044C 354 nt7.38□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 OGG1YML060W 1131 nt7.37□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 YMR279CYMR279C 1623 nt7.37□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 SEC23YPR181C 2307 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 HXT15YDL245C 1704 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 HXT16YJR158W 1704 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 HHY1YEL059W 309 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 YPL257WYPL257W 582 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 EDE1YBL047C 4146 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 SLX5YDL013W 1860 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 EFM1YHL039W 1758 nt7.36□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 STT3YGL022W 2157 nt7.35□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 RGD2YFL047W 2145 nt7.35□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 PAC10YGR078C 600 nt7.35□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 RRP46YGR095C 672 nt7.35□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 SWP1YMR149W 861 nt7.35□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 YDR387CYDR387C 1668 nt7.35□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 MPA43YNL249C 1629 nt7.34□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 POX1YGL205W 2247 nt7.34□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 PPH22YDL188C 1134 nt7.34□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 GCN3YKR026C 918 nt7.34□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 YMR295CYMR295C 594 nt7.34□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.34□□□□□ -1.23
CLF1Q12309 TAH11YJR046W 1815 nt7.33□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 KIN1YDR122W 3195 nt7.32□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 BUD9YGR041W 1644 nt7.32□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 MSP1YGR028W 1089 nt7.32□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 MPC2YHR162W 390 nt7.32□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 MIA40YKL195W 1212 nt7.32□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 YML018CYML018C 1182 nt7.32□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 MSO1YNR049C 633 nt7.32□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 PTC3YBL056W 1407 nt7.32□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 CYB2YML054C 1776 nt7.31□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 GDA1YEL042W 1557 nt7.31□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 MRPL10YNL284C 969 nt7.31□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 MKK1YOR231W 1527 nt7.31□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 RQC1YDR333C 2172 nt7.3□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 VMA2YBR127C 1554 nt7.29□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 COX16YJL003W 357 nt7.29□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 AAT2YLR027C 1257 nt7.28□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt7.28□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 ELP3YPL086C 1674 nt7.28□□□□□ -1.24
CLF1Q12309 YDR415CYDR415C 1125 nt7.27□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 YPT1YFL038C 621 nt7.27□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 DFR1YOR236W 636 nt7.27□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 ATF1YOR377W 1578 nt7.27□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 ARE2YNR019W 1929 nt7.27□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 YFR006WYFR006W 1608 nt7.27□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 PPT1YGR123C 1542 nt7.27□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 YBR284WYBR284W 2394 nt7.26□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 SRL2YLR082C 1179 nt7.26□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 ATP4YPL078C 735 nt7.26□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 LDB16YCL005W 771 nt7.26□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 HVG1YER039C 750 nt7.25□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 MDE1YJR024C 735 nt7.25□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 YJR084WYJR084W 1272 nt7.25□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 DID2YKR035W-A 615 nt7.25□□□□□ -1.25
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