Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pate4Q09098 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms