Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah2Q06986 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms