Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smpd1Q04519 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd1Q04519 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.5 ms