Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pfdn6Q03958 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pfdn6Q03958 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pfdn6Q03958 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms