Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hivep1Q03172 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hivep1Q03172 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hivep1Q03172 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms