Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tcf7Q00417 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcf7Q00417 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms