Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gata5P97489 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gata5P97489 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gata5P97489 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gata5P97489 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gata5P97489 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gata5P97489 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gata5P97489 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gata5P97489 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gata5P97489 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gata5P97489 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gata5P97489 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gata5P97489 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gata5P97489 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gata5P97489 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gata5P97489 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gata5P97489 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata5P97489 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gata5P97489 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata5P97489 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gata5P97489 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms