Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AurkaP97477 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AurkaP97477 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkaP97477 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkaP97477 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AurkaP97477 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AurkaP97477 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AurkaP97477 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AurkaP97477 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms