Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms