Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptprn2P80560 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptprn2P80560 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptprn2P80560 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms