Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtnP63089 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtnP63089 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtnP63089 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtnP63089 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PtnP63089 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtnP63089 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtnP63089 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtnP63089 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtnP63089 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtnP63089 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtnP63089 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtnP63089 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtnP63089 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtnP63089 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtnP63089 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtnP63089 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtnP63089 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtnP63089 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtnP63089 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtnP63089 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtnP63089 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtnP63089 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtnP63089 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtnP63089 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtnP63089 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtnP63089 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtnP63089 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtnP63089 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtnP63089 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtnP63089 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtnP63089 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtnP63089 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtnP63089 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtnP63089 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtnP63089 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtnP63089 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtnP63089 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtnP63089 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtnP63089 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtnP63089 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtnP63089 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtnP63089 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtnP63089 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtnP63089 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtnP63089 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtnP63089 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtnP63089 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtnP63089 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PtnP63089 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtnP63089 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtnP63089 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtnP63089 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtnP63089 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtnP63089 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtnP63089 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtnP63089 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtnP63089 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtnP63089 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtnP63089 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtnP63089 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtnP63089 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtnP63089 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtnP63089 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtnP63089 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtnP63089 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtnP63089 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtnP63089 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtnP63089 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtnP63089 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtnP63089 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtnP63089 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtnP63089 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtnP63089 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtnP63089 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtnP63089 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtnP63089 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtnP63089 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtnP63089 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtnP63089 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtnP63089 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PtnP63089 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtnP63089 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtnP63089 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtnP63089 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtnP63089 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtnP63089 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtnP63089 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtnP63089 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtnP63089 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtnP63089 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtnP63089 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtnP63089 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtnP63089 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtnP63089 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtnP63089 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtnP63089 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtnP63089 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtnP63089 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtnP63089 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms