Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hpcal1P62748 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hpcal1P62748 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hpcal1P62748 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms