Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rps13P62301 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps13P62301 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rps13P62301 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps13P62301 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps13P62301 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps13P62301 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps13P62301 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps13P62301 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps13P62301 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps13P62301 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps13P62301 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps13P62301 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps13P62301 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rps13P62301 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps13P62301 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms