Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vbp1P61759 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vbp1P61759 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vbp1P61759 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vbp1P61759 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms