Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrn4P59383 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn4P59383 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn4P59383 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn4P59383 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn4P59383 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrn4P59383 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrn4P59383 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrn4P59383 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrn4P59383 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms