Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Csrnp3P59055 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Csrnp3P59055 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Csrnp3P59055 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Csrnp3P59055 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Csrnp3P59055 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Csrnp3P59055 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Csrnp3P59055 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Csrnp3P59055 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Csrnp3P59055 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms