Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rhbdl3P58873 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rhbdl3P58873 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rhbdl3P58873 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rhbdl3P58873 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rhbdl3P58873 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rhbdl3P58873 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rhbdl3P58873 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rhbdl3P58873 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rhbdl3P58873 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms