Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samsn1P57725 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Samsn1P57725 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms