Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csrp3P50462 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Csrp3P50462 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrp3P50462 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrp3P50462 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrp3P50462 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrp3P50462 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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