Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psen1P49769 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psen1P49769 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psen1P49769 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psen1P49769 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Psen1P49769 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psen1P49769 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psen1P49769 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psen1P49769 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psen1P49769 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psen1P49769 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen1P49769 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms