Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CitP49025 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CitP49025 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CitP49025 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CitP49025 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CitP49025 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CitP49025 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CitP49025 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CitP49025 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CitP49025 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CitP49025 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CitP49025 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CitP49025 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CitP49025 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CitP49025 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CitP49025 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CitP49025 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CitP49025 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CitP49025 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CitP49025 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CitP49025 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CitP49025 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CitP49025 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CitP49025 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CitP49025 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CitP49025 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CitP49025 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CitP49025 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CitP49025 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CitP49025 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CitP49025 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CitP49025 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CitP49025 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CitP49025 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CitP49025 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CitP49025 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CitP49025 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CitP49025 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CitP49025 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CitP49025 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CitP49025 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CitP49025 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CitP49025 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CitP49025 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CitP49025 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CitP49025 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CitP49025 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CitP49025 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CitP49025 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CitP49025 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CitP49025 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CitP49025 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CitP49025 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CitP49025 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CitP49025 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CitP49025 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CitP49025 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CitP49025 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CitP49025 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CitP49025 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CitP49025 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CitP49025 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CitP49025 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CitP49025 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CitP49025 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CitP49025 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CitP49025 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CitP49025 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CitP49025 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CitP49025 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CitP49025 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CitP49025 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CitP49025 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CitP49025 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CitP49025 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CitP49025 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CitP49025 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CitP49025 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CitP49025 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CitP49025 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CitP49025 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CitP49025 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CitP49025 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CitP49025 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CitP49025 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CitP49025 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CitP49025 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CitP49025 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CitP49025 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CitP49025 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CitP49025 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CitP49025 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CitP49025 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CitP49025 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CitP49025 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CitP49025 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CitP49025 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CitP49025 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CitP49025 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CitP49025 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms