Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tulp2P46686 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Tulp2P46686 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tulp2P46686 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tulp2P46686 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms