Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NsfP46460 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsfP46460 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsfP46460 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsfP46460 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsfP46460 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NsfP46460 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsfP46460 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsfP46460 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsfP46460 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NsfP46460 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsfP46460 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NsfP46460 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NsfP46460 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NsfP46460 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NsfP46460 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NsfP46460 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NsfP46460 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NsfP46460 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NsfP46460 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NsfP46460 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NsfP46460 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NsfP46460 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NsfP46460 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NsfP46460 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NsfP46460 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NsfP46460 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NsfP46460 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsfP46460 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsfP46460 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NsfP46460 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsfP46460 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsfP46460 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsfP46460 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsfP46460 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsfP46460 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsfP46460 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsfP46460 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsfP46460 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsfP46460 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsfP46460 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsfP46460 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsfP46460 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsfP46460 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NsfP46460 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NsfP46460 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NsfP46460 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NsfP46460 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsfP46460 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NsfP46460 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NsfP46460 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsfP46460 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsfP46460 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsfP46460 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsfP46460 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsfP46460 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsfP46460 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsfP46460 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsfP46460 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsfP46460 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsfP46460 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsfP46460 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NsfP46460 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NsfP46460 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NsfP46460 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsfP46460 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsfP46460 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsfP46460 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsfP46460 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsfP46460 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsfP46460 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsfP46460 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsfP46460 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsfP46460 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NsfP46460 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NsfP46460 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NsfP46460 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NsfP46460 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NsfP46460 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NsfP46460 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NsfP46460 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NsfP46460 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NsfP46460 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NsfP46460 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NsfP46460 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NsfP46460 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NsfP46460 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsfP46460 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NsfP46460 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsfP46460 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsfP46460 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsfP46460 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsfP46460 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsfP46460 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsfP46460 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NsfP46460 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NsfP46460 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NsfP46460 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NsfP46460 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsfP46460 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms