Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klf1P46099 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf1P46099 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf1P46099 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf1P46099 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klf1P46099 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf1P46099 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf1P46099 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klf1P46099 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klf1P46099 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klf1P46099 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms