Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sept4P28661 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sept4P28661 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sept4P28661 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sept4P28661 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sept4P28661 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept4P28661 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sept4P28661 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sept4P28661 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms