Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NdnP25233 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NdnP25233 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NdnP25233 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NdnP25233 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NdnP25233 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NdnP25233 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NdnP25233 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NdnP25233 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NdnP25233 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NdnP25233 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NdnP25233 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NdnP25233 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NdnP25233 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NdnP25233 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NdnP25233 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NdnP25233 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NdnP25233 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NdnP25233 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NdnP25233 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NdnP25233 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NdnP25233 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NdnP25233 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NdnP25233 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NdnP25233 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NdnP25233 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NdnP25233 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NdnP25233 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NdnP25233 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NdnP25233 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NdnP25233 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NdnP25233 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NdnP25233 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NdnP25233 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NdnP25233 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NdnP25233 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NdnP25233 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NdnP25233 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NdnP25233 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NdnP25233 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NdnP25233 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NdnP25233 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NdnP25233 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NdnP25233 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NdnP25233 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NdnP25233 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NdnP25233 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NdnP25233 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NdnP25233 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NdnP25233 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NdnP25233 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NdnP25233 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NdnP25233 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NdnP25233 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NdnP25233 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NdnP25233 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NdnP25233 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NdnP25233 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NdnP25233 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NdnP25233 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NdnP25233 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NdnP25233 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NdnP25233 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NdnP25233 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NdnP25233 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NdnP25233 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NdnP25233 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NdnP25233 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NdnP25233 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NdnP25233 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NdnP25233 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NdnP25233 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NdnP25233 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NdnP25233 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NdnP25233 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NdnP25233 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NdnP25233 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NdnP25233 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NdnP25233 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NdnP25233 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NdnP25233 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NdnP25233 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NdnP25233 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NdnP25233 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NdnP25233 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NdnP25233 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NdnP25233 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NdnP25233 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.8 ms