Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl13aP19253 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl13aP19253 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms