Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phka1P18826 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phka1P18826 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Phka1P18826 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phka1P18826 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Phka1P18826 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phka1P18826 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phka1P18826 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phka1P18826 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phka1P18826 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phka1P18826 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phka1P18826 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phka1P18826 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms