Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SellP18337 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SellP18337 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SellP18337 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SellP18337 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SellP18337 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SellP18337 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SellP18337 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SellP18337 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SellP18337 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SellP18337 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SellP18337 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SellP18337 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SellP18337 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SellP18337 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SellP18337 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SellP18337 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SellP18337 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SellP18337 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SellP18337 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SellP18337 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SellP18337 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SellP18337 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SellP18337 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SellP18337 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SellP18337 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SellP18337 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SellP18337 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SellP18337 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SellP18337 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SellP18337 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SellP18337 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SellP18337 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SellP18337 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SellP18337 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SellP18337 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SellP18337 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SellP18337 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SellP18337 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SellP18337 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SellP18337 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SellP18337 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SellP18337 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SellP18337 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SellP18337 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SellP18337 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SellP18337 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SellP18337 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SellP18337 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SellP18337 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SellP18337 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SellP18337 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SellP18337 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SellP18337 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SellP18337 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SellP18337 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SellP18337 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SellP18337 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SellP18337 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SellP18337 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SellP18337 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SellP18337 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SellP18337 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SellP18337 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SellP18337 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SellP18337 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SellP18337 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SellP18337 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SellP18337 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SellP18337 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SellP18337 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SellP18337 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SellP18337 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SellP18337 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SellP18337 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SellP18337 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SellP18337 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SellP18337 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SellP18337 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SellP18337 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SellP18337 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SellP18337 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SellP18337 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SellP18337 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SellP18337 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SellP18337 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SellP18337 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SellP18337 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SellP18337 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SellP18337 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SellP18337 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SellP18337 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SellP18337 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SellP18337 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SellP18337 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SellP18337 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SellP18337 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SellP18337 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SellP18337 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SellP18337 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms