Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxb1P17919 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxb1P17919 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms