Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Defa-rs1P17533 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa-rs1P17533 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa-rs1P17533 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms