Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prph2P15499 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prph2P15499 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prph2P15499 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prph2P15499 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prph2P15499 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prph2P15499 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prph2P15499 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prph2P15499 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prph2P15499 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prph2P15499 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prph2P15499 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prph2P15499 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prph2P15499 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prph2P15499 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms