Protein–RNA interactions for Protein: P12979

Myog, Myogenin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyogP12979 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyogP12979 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyogP12979 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyogP12979 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyogP12979 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MyogP12979 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MyogP12979 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MyogP12979 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyogP12979 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyogP12979 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyogP12979 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyogP12979 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyogP12979 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MyogP12979 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyogP12979 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyogP12979 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyogP12979 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MyogP12979 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MyogP12979 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MyogP12979 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MyogP12979 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MyogP12979 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MyogP12979 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MyogP12979 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MyogP12979 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MyogP12979 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MyogP12979 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MyogP12979 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MyogP12979 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyogP12979 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyogP12979 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MyogP12979 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MyogP12979 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MyogP12979 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MyogP12979 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyogP12979 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyogP12979 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyogP12979 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyogP12979 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MyogP12979 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyogP12979 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MyogP12979 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyogP12979 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyogP12979 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyogP12979 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MyogP12979 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyogP12979 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MyogP12979 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyogP12979 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyogP12979 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyogP12979 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MyogP12979 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyogP12979 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyogP12979 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyogP12979 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyogP12979 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyogP12979 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MyogP12979 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MyogP12979 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyogP12979 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MyogP12979 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MyogP12979 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MyogP12979 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MyogP12979 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MyogP12979 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MyogP12979 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MyogP12979 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MyogP12979 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MyogP12979 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MyogP12979 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MyogP12979 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MyogP12979 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MyogP12979 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MyogP12979 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MyogP12979 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MyogP12979 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MyogP12979 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MyogP12979 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyogP12979 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyogP12979 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyogP12979 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyogP12979 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MyogP12979 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyogP12979 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyogP12979 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyogP12979 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MyogP12979 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MyogP12979 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MyogP12979 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MyogP12979 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MyogP12979 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MyogP12979 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MyogP12979 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MyogP12979 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MyogP12979 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MyogP12979 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MyogP12979 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MyogP12979 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MyogP12979 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MyogP12979 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms