Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timp1P12032 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Timp1P12032 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timp1P12032 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timp1P12032 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timp1P12032 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timp1P12032 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timp1P12032 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Timp1P12032 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Timp1P12032 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Timp1P12032 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timp1P12032 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timp1P12032 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timp1P12032 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timp1P12032 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timp1P12032 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Timp1P12032 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timp1P12032 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms