Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtcP11725 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtcP11725 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtcP11725 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtcP11725 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtcP11725 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtcP11725 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtcP11725 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtcP11725 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtcP11725 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtcP11725 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OtcP11725 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtcP11725 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtcP11725 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtcP11725 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OtcP11725 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtcP11725 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtcP11725 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OtcP11725 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtcP11725 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtcP11725 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
OtcP11725 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtcP11725 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtcP11725 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtcP11725 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtcP11725 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtcP11725 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OtcP11725 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OtcP11725 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OtcP11725 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OtcP11725 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OtcP11725 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OtcP11725 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OtcP11725 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtcP11725 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtcP11725 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OtcP11725 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtcP11725 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtcP11725 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtcP11725 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtcP11725 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtcP11725 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtcP11725 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OtcP11725 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtcP11725 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OtcP11725 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtcP11725 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtcP11725 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtcP11725 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtcP11725 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtcP11725 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OtcP11725 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OtcP11725 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OtcP11725 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OtcP11725 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OtcP11725 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OtcP11725 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OtcP11725 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OtcP11725 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OtcP11725 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OtcP11725 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OtcP11725 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OtcP11725 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OtcP11725 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OtcP11725 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtcP11725 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtcP11725 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtcP11725 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtcP11725 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtcP11725 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtcP11725 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OtcP11725 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OtcP11725 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OtcP11725 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OtcP11725 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OtcP11725 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OtcP11725 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtcP11725 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtcP11725 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtcP11725 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtcP11725 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtcP11725 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtcP11725 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtcP11725 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtcP11725 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtcP11725 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtcP11725 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms