Protein–RNA interactions for Protein: P11499

Hsp90ab1, Heat shock protein HSP 90-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsp90ab1P11499 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hsp90ab1P11499 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Hsp90ab1P11499 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hsp90ab1P11499 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hsp90ab1P11499 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms