Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Amd1P0DMN7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Amd1P0DMN7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Amd1P0DMN7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Amd1P0DMN7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms