Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa4P06798 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa4P06798 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa4P06798 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms