Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn3P06796 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn3P06796 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn3P06796 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csn3P06796 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn3P06796 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn3P06796 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csn3P06796 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csn3P06796 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn3P06796 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn3P06796 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csn3P06796 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.7 ms