Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lamc1P02468 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc1P02468 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lamc1P02468 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lamc1P02468 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms