Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01793 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01793 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01793 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01793 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01793 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01793 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01793 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01793 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01793 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01793 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01793 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01793 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01793 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01793 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01793 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01793 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01793 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01793 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01793 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01793 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01793 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01793 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01793 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01793 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01793 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01793 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01793 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01793 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01793 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01793 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01793 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01793 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01793 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01793 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01793 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01793 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01793 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01793 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01793 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01793 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01793 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01793 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01793 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01793 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01793 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01793 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01793 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01793 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01793 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01793 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01793 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01793 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01793 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01793 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01793 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01793 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01793 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01793 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01793 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01793 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01793 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01793 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01793 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01793 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01793 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01793 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01793 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01793 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01793 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01793 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01793 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01793 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01793 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01793 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01793 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01793 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01793 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01793 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01793 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01793 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01793 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01793 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01793 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01793 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01793 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms