Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01734 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01734 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01734 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01734 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01734 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01734 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01734 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01734 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01734 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01734 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01734 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01734 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01734 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01734 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01734 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01734 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01734 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01734 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01734 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01734 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01734 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01734 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01734 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01734 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01734 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01734 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01734 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01734 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01734 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01734 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01734 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01734 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01734 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01734 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01734 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01734 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
P01734 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
P01734 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01734 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01734 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01734 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01734 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01734 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01734 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01734 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01734 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01734 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01734 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01734 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
P01734 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01734 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01734 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01734 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01734 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01734 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01734 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01734 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01734 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01734 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01734 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01734 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01734 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01734 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
P01734 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01734 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01734 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01734 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01734 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01734 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01734 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01734 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01734 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01734 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01734 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01734 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01734 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01734 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01734 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01734 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01734 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01734 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01734 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01734 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01734 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01734 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01734 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01734 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01734 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01734 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01734 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01734 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01734 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01734 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01734 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01734 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01734 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01734 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
P01734 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01734 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms