Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4bP01029 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4bP01029 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4bP01029 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4bP01029 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
C4bP01029 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
C4bP01029 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4bP01029 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4bP01029 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4bP01029 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4bP01029 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4bP01029 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4bP01029 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4bP01029 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C4bP01029 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C4bP01029 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C4bP01029 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C4bP01029 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C4bP01029 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4bP01029 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4bP01029 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4bP01029 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4bP01029 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4bP01029 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4bP01029 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4bP01029 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4bP01029 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4bP01029 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4bP01029 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4bP01029 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4bP01029 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4bP01029 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4bP01029 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4bP01029 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4bP01029 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C4bP01029 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C4bP01029 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C4bP01029 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C4bP01029 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4bP01029 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4bP01029 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4bP01029 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4bP01029 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
C4bP01029 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4bP01029 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4bP01029 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C4bP01029 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C4bP01029 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C4bP01029 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C4bP01029 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C4bP01029 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C4bP01029 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C4bP01029 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4bP01029 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4bP01029 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4bP01029 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C4bP01029 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C4bP01029 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C4bP01029 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4bP01029 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
C4bP01029 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4bP01029 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4bP01029 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4bP01029 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4bP01029 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C4bP01029 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4bP01029 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4bP01029 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
C4bP01029 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4bP01029 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4bP01029 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4bP01029 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4bP01029 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4bP01029 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4bP01029 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4bP01029 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
C4bP01029 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4bP01029 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4bP01029 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4bP01029 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4bP01029 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4bP01029 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
C4bP01029 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4bP01029 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4bP01029 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4bP01029 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4bP01029 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4bP01029 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4bP01029 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4bP01029 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4bP01029 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4bP01029 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4bP01029 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4bP01029 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4bP01029 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4bP01029 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4bP01029 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C4bP01029 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C4bP01029 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C4bP01029 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms