Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Setdb1O88974 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Setdb1O88974 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Setdb1O88974 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Setdb1O88974 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms