Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ShdO88834 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ShdO88834 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ShdO88834 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ShdO88834 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ShdO88834 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ShdO88834 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ShdO88834 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ShdO88834 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ShdO88834 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ShdO88834 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ShdO88834 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ShdO88834 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ShdO88834 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ShdO88834 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ShdO88834 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ShdO88834 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ShdO88834 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ShdO88834 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ShdO88834 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ShdO88834 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ShdO88834 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ShdO88834 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ShdO88834 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ShdO88834 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ShdO88834 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ShdO88834 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ShdO88834 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ShdO88834 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ShdO88834 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ShdO88834 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ShdO88834 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ShdO88834 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ShdO88834 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ShdO88834 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ShdO88834 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ShdO88834 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ShdO88834 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ShdO88834 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ShdO88834 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ShdO88834 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ShdO88834 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ShdO88834 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ShdO88834 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ShdO88834 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ShdO88834 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ShdO88834 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ShdO88834 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ShdO88834 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ShdO88834 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ShdO88834 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ShdO88834 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ShdO88834 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ShdO88834 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ShdO88834 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ShdO88834 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ShdO88834 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ShdO88834 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ShdO88834 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ShdO88834 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ShdO88834 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ShdO88834 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ShdO88834 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ShdO88834 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ShdO88834 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ShdO88834 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ShdO88834 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ShdO88834 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ShdO88834 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ShdO88834 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ShdO88834 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ShdO88834 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ShdO88834 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ShdO88834 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ShdO88834 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ShdO88834 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ShdO88834 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ShdO88834 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ShdO88834 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ShdO88834 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ShdO88834 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShdO88834 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShdO88834 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShdO88834 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShdO88834 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShdO88834 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShdO88834 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ShdO88834 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShdO88834 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShdO88834 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShdO88834 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ShdO88834 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShdO88834 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ShdO88834 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ShdO88834 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShdO88834 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShdO88834 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShdO88834 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShdO88834 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ShdO88834 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms