Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ComtO88587 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ComtO88587 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ComtO88587 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ComtO88587 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ComtO88587 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ComtO88587 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ComtO88587 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ComtO88587 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ComtO88587 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ComtO88587 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ComtO88587 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ComtO88587 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ComtO88587 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ComtO88587 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ComtO88587 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ComtO88587 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ComtO88587 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ComtO88587 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ComtO88587 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ComtO88587 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ComtO88587 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ComtO88587 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ComtO88587 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ComtO88587 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ComtO88587 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ComtO88587 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ComtO88587 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ComtO88587 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ComtO88587 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ComtO88587 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ComtO88587 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ComtO88587 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ComtO88587 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ComtO88587 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ComtO88587 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ComtO88587 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ComtO88587 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ComtO88587 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ComtO88587 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ComtO88587 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ComtO88587 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ComtO88587 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ComtO88587 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ComtO88587 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ComtO88587 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ComtO88587 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ComtO88587 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ComtO88587 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ComtO88587 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ComtO88587 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ComtO88587 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ComtO88587 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ComtO88587 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ComtO88587 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ComtO88587 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ComtO88587 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ComtO88587 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ComtO88587 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ComtO88587 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ComtO88587 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ComtO88587 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ComtO88587 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ComtO88587 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ComtO88587 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ComtO88587 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ComtO88587 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ComtO88587 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ComtO88587 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ComtO88587 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ComtO88587 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ComtO88587 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ComtO88587 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ComtO88587 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ComtO88587 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ComtO88587 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ComtO88587 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ComtO88587 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ComtO88587 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ComtO88587 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ComtO88587 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ComtO88587 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ComtO88587 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ComtO88587 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ComtO88587 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ComtO88587 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ComtO88587 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ComtO88587 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ComtO88587 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ComtO88587 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ComtO88587 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ComtO88587 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ComtO88587 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ComtO88587 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ComtO88587 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ComtO88587 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ComtO88587 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ComtO88587 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ComtO88587 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ComtO88587 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms